基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA01G004170 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr01:1090394-1093734 (+) |
| 描述 | Similar to CCT2: Choline-phosphate cytidylyltransferase 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_005964 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g15130 |
在磷脂磷脂酰胆碱的生物合成中起重要作用。 | |
At2g32260 |
在磷脂磷脂酰胆碱的生物合成中起重要作用。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006656 | phosphatidylcholine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.206; 覆盖度=92.203; E 值=2.5e-152; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006657 | CDP-choline pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.357; 覆盖度=75.932; E 值=3.39e-83; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0007283 | spermatogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.911; 覆盖度=75.932; E 值=1.01e-82; UniProt GO evidence=IMP:MGI | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1904116 | response to vasopressin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=54.911; 覆盖度=75.932; E 值=1.06e-82; UniProt GO evidence=IEP:RGD | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.206; 覆盖度=92.203; E 值=2.5e-152; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.789; 覆盖度=96.61; E 值=2.45e-151; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.357; 覆盖度=75.932; E 值=3.39e-83; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.357; 覆盖度=75.932; E 值=3.39e-83; UniProt GO evidence=TAS:Reactome | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004105 | choline-phosphate cytidylyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.206; 覆盖度=92.203; E 值=2.5e-152; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031210 | phosphatidylcholine binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.206; 覆盖度=92.203; E 值=2.5e-152; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.911; 覆盖度=75.932; E 值=1.01e-82; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G32260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=75.789; 覆盖度=96.61; E 值=2.45e-151 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G15130 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=77.206; 覆盖度=92.203; E 值=2.5e-152 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:9468 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=55.357; 覆盖度=75.932; E 值=3.39e-83 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:236899 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.911; 覆盖度=75.932; E 值=1.01e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:286936 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=54.911; 覆盖度=75.932; E 值=1.06e-82 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |