基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_037919 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr09:25402987-25403551 (-) |
| 描述 | Similar to HIPP16: Heavy metal-associated isoprenylated plant protein 16 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037919 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: F7J0N2 |
抗病(R)蛋白,能够识别来自稻瘟病菌 M.oryzae 的 AVR-Pia 和 AVR1-CO39 效应子无毒化蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: F2VYU4 |
疾病抗性(R)蛋白,特异性识别稻瘟病菌 M. oryzae 的 AVR-Pik 效应子复敏蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: B5UBC1 |
疾病抗性(R)蛋白,特异性识别稻瘟病菌 M. oryzae 的 AVR-Pik 效应子复敏蛋白。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002758 | innate immune response-activating signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.135; 覆盖度=65.487; E 值=9.5e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009626 | plant-type hypersensitive response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042742 | defense response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051707 | response to other organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=35.135; 覆盖度=65.487; E 值=9.5e-08; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0062207 | regulation of pattern recognition receptor signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=EXP:PHI-base | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=68.142; E 值=4.62e-13; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=EXP:PHI-base | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043531 | ADP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=36.634; 覆盖度=89.381; E 值=2.19e-10; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=68.142; E 值=4.62e-13; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G07600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.857; 覆盖度=68.142; E 值=4.62e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G48290 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.529; 覆盖度=75.221; E 值=9.16e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |