基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_037021 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:51802811-51805474 (+) |
| 描述 | Similar to ROPGAP2: Rho GTPase-activating protein 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_037021 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g03100 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g22400 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g46710 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g11490 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | |
At1g08340 |
通过将Rac型GTP酶转换为不活跃的GDP结合状态,作为其GTP酶激活剂。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0007165 | signal transduction | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.914; 覆盖度=70.12; E 值=1.16e-159; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009664 | plant-type cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.599; 覆盖度=66.024; E 值=8.81e-125; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0034059 | response to anoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.786; 覆盖度=67.47; E 值=8.07e-121; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.914; 覆盖度=70.12; E 值=1.16e-159; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.599; 覆盖度=66.024; E 值=8.81e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.123; 覆盖度=78.554; E 值=3.86e-131; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009531 | secondary cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.599; 覆盖度=66.024; E 值=8.81e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005096 | GTPase activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.914; 覆盖度=70.12; E 值=1.16e-159; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G08340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=62.308; 覆盖度=62.651; E 值=4.07e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G46710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=64.599; 覆盖度=66.024; E 值=8.81e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G11490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=61.786; 覆盖度=67.47; E 值=8.07e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G03100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.914; 覆盖度=70.12; E 值=1.16e-159 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G22400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=60.123; 覆盖度=78.554; E 值=3.86e-131 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |