基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_037015 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:51728537-51729474 (-) |
| 描述 | Similar to CCS1: Cytochrome c biogenesis protein CCS1%2C chloroplastic (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_037015 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g49380 |
在c型细胞色素（细胞色素c6和细胞色素f）生物合成过程中的血红素连接步骤中必需。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0769600 |
在c型细胞色素（细胞色素c6和细胞色素f）生物合成过程中的血红素连接步骤中必需。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0017004 | cytochrome complex assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.0; 覆盖度=48.077; E 值=1.32e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.327; 覆盖度=54.327; E 值=7.64e-27; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.0; 覆盖度=48.077; E 值=1.32e-27; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ana:alr3123 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.0; 覆盖度=48.077; E 值=3e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G49380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=51.327; 覆盖度=54.327; E 值=7.64e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ava:Ava_3824 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.0; 覆盖度=48.077; E 值=2.73e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0769600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=56.0; 覆盖度=48.077; E 值=1.32e-27 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |