基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036970 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:51025796-51028127 (-) |
| 描述 | Similar to RRF: Ribosome-recycling factor%2C chloroplastic (Fragment) (Daucus carota OX%3D4039) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_036970 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g63190 |
负责在叶绿体蛋白质生物合成终止时释放信使 RNA 上的核糖体。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0570700 |
负责在叶绿体蛋白质生物合成终止时释放信使 RNA 上的核糖体。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2YMU2 |
负责在叶绿体蛋白质生物合成终止时释放信使 RNA 上的核糖体。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009658 | chloroplast organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0032544 | plastid translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.194; 覆盖度=86.644; E 值=1.2e-114; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0050832 | defense response to fungus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.194; 覆盖度=86.644; E 值=1.2e-114; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.636; 覆盖度=94.178; E 值=5.61e-109; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005507 | copper ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043023 | ribosomal large subunit binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=67.194; 覆盖度=86.644; E 值=1.2e-114; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G63190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.204; 覆盖度=100.685; E 值=7.44e-107 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0570700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.65; 覆盖度=67.466; E 值=4.49e-108 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |