基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_036931 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:50268519-50271338 (+) |
| 描述 | Similar to D27: Beta-carotene isomerase D27%2C chloroplastic (Medicago truncatula OX%3D3880) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_036931 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g03055 |
催化β-胡萝卜素C9-C10双键的异构化，将全反式β-胡萝卜素转化为9-顺式β-胡萝卜素，为独脚金内酯生物合成中的CCD7反应提供底物。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os11g0587000 |
催化β-胡萝卜素C9-C10双键的异构化，将全反式β-胡萝卜素转化为9-顺式β-胡萝卜素，为独脚金内酯生物合成中的CCD7反应提供底物。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010223 | secondary shoot formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.238; 覆盖度=76.087; E 值=2.75e-81; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1901601 | strigolactone biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.238; 覆盖度=76.087; E 值=2.75e-81; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.935; 覆盖度=89.855; E 值=5.49e-69; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.375; 覆盖度=100.362; E 值=4.47e-90; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.935; 覆盖度=89.855; E 值=5.49e-69; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005506 | iron ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.375; 覆盖度=100.362; E 值=4.47e-90; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016859 | cis-trans isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.238; 覆盖度=76.087; E 值=2.75e-81; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0106365 | beta-carotene isomerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.375; 覆盖度=100.362; E 值=4.47e-90; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G03055 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=41.935; 覆盖度=89.855; E 值=5.49e-69 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mtr:25485781 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.375; 覆盖度=100.362; E 值=4.47e-90 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:107276001 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=55.238; 覆盖度=76.087; E 值=2.75e-81 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |