基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035435 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:22461166-22462959 (-) |
| 描述 | Similar to Smg9: Protein SMG9 (Rattus norvegicus OX%3D10116) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035435 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 3 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000184 | nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.121; 覆盖度=89.216; E 值=8.46e-37; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902554 | serine/threonine protein kinase complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.121; 覆盖度=89.216; E 值=8.46e-37; UniProt GO evidence=ISO:RGD | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042802 | identical protein binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.121; 覆盖度=89.216; E 值=8.46e-37; UniProt GO evidence=ISO:RGD | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | mmu:71997 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.198; 覆盖度=89.216; E 值=1.2e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:365215 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=29.121; 覆盖度=89.216; E 值=8.46e-37 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sasa:100194832 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.551; 覆盖度=96.078; E 值=1.74e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | xla:779402 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=30.471; 覆盖度=88.48; E 值=3.31e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | xtr:100216177 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.146; 覆盖度=107.108; E 值=2.47e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |