基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_035112 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr08:14752300-14753610 (-) |
| 描述 | Similar to Uncharacterized 38.1 kDa protein (Capnoides sempervirens OX%3D3464) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_035112 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g40410 |
磷酸二酯键 5' 位催化 DNA 和 RNA 水解的酶。 |
Molecular cloning, expression, and characterization of a Ca2+-dependent nuclease of Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1016/j.pep.2012.03.007
|
At3g56170 |
磷酸二酯键 5' 位催化 DNA 和 RNA 水解的酶。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0109200 |
磷酸二酯键 5' 位催化 DNA 和 RNA 水解的酶。 | 暂无已核实直接文献 |
Os11g0109500 |
磷酸二酯键 5' 位催化 DNA 和 RNA 水解的酶。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006308 | DNA catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006401 | RNA catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.635; 覆盖度=73.498; E 值=2.11e-55; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003676 | nucleic acid binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.635; 覆盖度=73.498; E 值=2.11e-55; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004518 | nuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.312; 覆盖度=65.724; E 值=7.22e-53; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004519 | endonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.635; 覆盖度=73.498; E 值=2.11e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004520 | DNA endonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004521 | RNA endonuclease activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016787 | hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=46.635; 覆盖度=73.498; E 值=2.11e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G40410 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=49.733; 覆盖度=66.078; E 值=4.62e-55 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G56170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.312; 覆盖度=65.724; E 值=7.22e-53 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0109500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.898; 覆盖度=69.258; E 值=8.91e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0109200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=45.408; 覆盖度=69.258; E 值=1.43e-52 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |