基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_033138 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:36947004-36948495 (-) |
| 描述 | Similar to PSA2: Protein PHOTOSYSTEM I ASSEMBLY 2%2C chloroplastic (Zea mays OX%3D4577) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_033138 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g34860 |
参与雌配子体发育。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os08g0463900 |
核基因组编码的因子,在植物发育过程中光系统 I (PSI) 的积累中必需。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009561 | megagametogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010027 | thylakoid membrane organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048564 | photosystem I assembly | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0047134 | protein-disulfide reductase [NAD(P)H] activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G34860 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=68.992; 覆盖度=59.722; E 值=2.21e-58 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os08g0463900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.248; 覆盖度=65.278; E 值=1.71e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4345779 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=65.248; 覆盖度=65.278; E 值=1.71e-60 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | zma:100277608 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=54.011; 覆盖度=86.574; E 值=9.86e-62 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |