基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_033001 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr07:33153725-33154285 (-) |
| 描述 | Similar to At4g04670: tRNA wybutosine-synthesizing protein 2/3/4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_033001 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 7 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g04670 |
依赖 S-腺苷-L-蛋氨酸的转移酶,作为韦布托辛(wybutosine)生物合成途径的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os07g0515000 |
依赖 S-腺苷-L-蛋氨酸的转移酶,作为韦布托辛(wybutosine)生物合成途径的组成部分。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0030488 | tRNA methylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031591 | wybutosine biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.704; 覆盖度=43.2; E 值=4.49e-12; UniProt GO evidence=HDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.704; 覆盖度=43.2; E 值=4.49e-12; UniProt GO evidence=HDA:PomBase | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008175 | tRNA methyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0102522 | tRNA 4-demethylwyosine alpha-amino-alpha-carboxypropyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G04670 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=62.025; 覆盖度=63.2; E 值=5.06e-23 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os07g0515000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=62.069; 覆盖度=46.4; E 值=7.39e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pab:PAB0615 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=44.828; 覆盖度=46.4; E 值=1.37e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pho:PH1069 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=44.828; 覆盖度=46.4; E 值=4.65e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | spo:2542730 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=53.704; 覆盖度=43.2; E 值=4.49e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |