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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_031343
当前查询版本OH1004
位置Chr07:4824050-4826854 (-)
描述Similar to Os03g0167500: Receptor homology region%2C transmembrane domain- and RING domain-containing protein 1 (Oryza sativa subsp. japonica OX%3D39947)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_031343 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g71980 参与液泡蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At1g35630 参与液泡蛋白运输。 暂无已核实直接文献
At1g35625 参与液泡蛋白运输。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0167500 参与液泡蛋白运输。 暂无已核实直接文献
Os08g0104300 参与液泡蛋白运输。 暂无已核实直接文献

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0015031protein transport生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000139Golgi membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000326protein storage vacuole细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.085; 覆盖度=105.938; E 值=2.26e-95; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005634nucleus细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.085; 覆盖度=105.938; E 值=2.26e-95; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.157; 覆盖度=71.021; E 值=1.89e-84; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0012505endomembrane system细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.4; 覆盖度=106.176; E 值=6.79e-102; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ARBAUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0032586protein storage vacuole membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0008270zinc ion binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0061630ubiquitin protein ligase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G35625KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.0; 覆盖度=71.259; E 值=3.22e-79UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G35630KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=47.157; 覆盖度=71.021; E 值=1.89e-84UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G71980KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=47.085; 覆盖度=105.938; E 值=2.26e-95UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os03g0167500KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.733; 覆盖度=99.525; E 值=6.64e-106UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os08g0104300KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=43.4; 覆盖度=106.176; E 值=6.79e-102UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release