基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_030652 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:120313230-120314018 (+) |
| 描述 | Similar to PRE4: Transcription factor PRE4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_030652 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g47710 |
非典型且可能非 DNA 结合的 bHLH 转录因子,整合多个信号通路来调节细胞伸长和植物发育。 | |
At3g28857 |
非典型且可能非 DNA 结合的 bHLH 转录因子,整合多个信号通路来调节细胞伸长和植物发育。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g74500 |
胚胎中 MONOPTEROS 依赖性根起始所需的非典型且可能非 DNA 结合的 bHLH 转录因子。 | |
At1g26945 |
非典型且可能不与DNA结合的bHLH转录因子,通过结合并抑制bHLH转录因子HFR1的活性来调节光介导的昼光反应,HFR1是光信号和遮荫回避的重要调节因子。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os10g0404300 |
非典型且可能非 DNA 结合的 bHLH 转录因子,整合多个信号通路来调节细胞伸长和植物发育。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.33; 覆盖度=101.111; E 值=3.9e-34; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=78.667; 覆盖度=83.333; E 值=2.72e-33; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009640 | photomorphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010086 | embryonic root morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0040008 | regulation of growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048510 | regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G26945 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=78.667; 覆盖度=83.333; E 值=2.72e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G74500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=74.026; 覆盖度=85.556; E 值=4.24e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G28857 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=70.33; 覆盖度=101.111; E 值=3.9e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G47710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.652; 覆盖度=102.222; E 值=1.27e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:107277392 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.789; 覆盖度=84.444; E 值=2.2e-28 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |