基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_027086 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:8569443-8573107 (+) |
| 描述 | Similar to RBP45: Polyadenylate-binding protein RBP45 (Nicotiana plumbaginifolia OX%3D4092) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_027086 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g11650 |
异质核核糖核蛋白 - 结合 mRNA 聚腺苷酸尾的蛋白质,可能参与前 mRNA 成熟的某些步骤。 | |
At4g27000 |
异质核核糖核蛋白(hnRNP)蛋白,结合mRNA的poly(A)尾,可能参与前mRNA成熟的某些步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g54900 |
异质核核糖核蛋白(hnRNP)蛋白,结合mRNA的poly(A)尾,可能参与前mRNA成熟的某些步骤。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0625800 |
RNA 结合蛋白,与谷醇溶蛋白 RNA 的 5'-CDS 内的顺式定位元件或邮政编码结合。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006397 | mRNA processing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.214; 覆盖度=81.553; E 值=9.61e-164; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010193 | response to ozone | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.042; 覆盖度=86.165; E 值=5.42e-162; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051028 | mRNA transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.769; 覆盖度=80.825; E 值=9.64e-149; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.042; 覆盖度=86.165; E 值=5.42e-162; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.214; 覆盖度=81.553; E 值=9.61e-164; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.769; 覆盖度=80.825; E 值=9.64e-149; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.214; 覆盖度=81.553; E 值=9.61e-164; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010494 | cytoplasmic stress granule | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.042; 覆盖度=86.165; E 值=5.42e-162; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.042; 覆盖度=86.165; E 值=5.42e-162; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.214; 覆盖度=81.553; E 值=9.61e-164; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008143 | poly(A) binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=73.214; 覆盖度=81.553; E 值=9.61e-164; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G11650 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=67.042; 覆盖度=86.165; E 值=5.42e-162 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G27000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=66.562; 覆盖度=77.67; E 值=8.63e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G54900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=65.732; 覆盖度=77.913; E 值=8.41e-145 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0625800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.769; 覆盖度=80.825; E 值=9.64e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4337064 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=68.769; 覆盖度=80.825; E 值=9.64e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |