基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_026898 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:4983242-4984453 (-) |
| 描述 | Similar to SPL8: Squamosa promoter-binding-like protein 8 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026898 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 15 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g02065 |
与共有核苷酸序列 5'-TNCGTACAA-3' 特异性结合的反式作用因子。 |
SPL8, an SBP-box gene that affects pollen sac development in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.010678
|
At1g20980 |
特异性结合共有核苷酸序列5′-TNCGTACAA-3′的反式作用因子(基于相似性推测)。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: Q01KM7 |
可能的转录因子,在叶片和叶鞘边界之间建立层状连接中起重要作用,从而控制叶舌和叶耳的发育。 | 暂无已核实直接文献 |
Os04g0656500 |
可能的转录因子,在叶片和叶鞘边界之间建立层状连接中起重要作用,从而控制叶舌和叶耳的发育。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.136; 覆盖度=31.034; E 值=2.49e-33; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009554 | megasporogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009555 | pollen development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009556 | microsporogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030154 | cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045893 | positive regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.136; 覆盖度=31.034; E 值=2.49e-33; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048653 | anther development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000976 | transcription cis-regulatory region binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0001216 | DNA-binding transcription activator activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.136; 覆盖度=31.034; E 值=2.49e-33; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G02065 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=42.282; 覆盖度=114.176; E 值=5.78e-51 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G20980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=69.136; 覆盖度=31.034; E 值=2.49e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0656500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=77.215; 覆盖度=30.268; E 值=1.56e-35 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |