基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_026847 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:3698059-3701159 (+) |
| 描述 | Similar to PMEI9: Pectinesterase inhibitor 9 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026847 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g62770 |
果胶甲酯酶 抑制剂,可能以中等 pH 依赖性方式靶向根部表达的 PME 和 PME3,主要在微酸性条件下,在某种程度上在 pH 7.5 下。 | |
At4g25260 |
果胶甲酯酶 抑制剂,可以以 pH 依赖性方式靶向 PME3,主要在弱酸性条件下但不在 pH 7.0 下。 | |
At3g47380 |
果胶甲酯酶(PME)抑制剂,参与对坏死性病原体反应中的细胞壁完整性维持。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g20740 |
果胶甲酯酶(PME)抑制因子,以pH依赖的方式作用于PME2、PME3等酶;主要在弱酸性条件(pH 6.3和5.0)下发挥作用,在pH 7.5时不发挥该作用。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009641 | shade avoidance | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.716; 覆盖度=73.303; E 值=1.38e-21; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009827 | plant-type cell wall modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071669 | plant-type cell wall organization or biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.278; 覆盖度=71.493; E 值=3.35e-20; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1902183 | regulation of shoot apical meristem development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.638; 覆盖度=90.045; E 值=4.06e-14; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.278; 覆盖度=71.493; E 值=3.35e-20; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.638; 覆盖度=90.045; E 值=4.06e-14; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048046 | apoplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004857 | enzyme inhibitor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046910 | pectinesterase inhibitor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G62770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.257; 覆盖度=77.376; E 值=1.79e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G47380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.278; 覆盖度=71.493; E 值=3.35e-20 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G25260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.716; 覆盖度=73.303; E 值=1.38e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G20740 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=27.638; 覆盖度=90.045; E 值=4.06e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |