基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_026775 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr06:2757414-2758284 (+) |
| 描述 | Similar to VIT1: Vacuolar iron transporter 1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_026775 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g01770 |
液泡铁转运蛋白,参与将铁离子从胞浆转运至液泡以进行细胞内铁储存。 |
Localization of iron in Arabidopsis seed requires the vacuolar membrane transporter VIT1.2006 · DOI: 10.1126/science.1132563
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006826 | iron ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.969; 覆盖度=99.62; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006879 | intracellular iron ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.941; 覆盖度=83.27; E 值=2.64e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030026 | intracellular manganese ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.969; 覆盖度=99.62; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0060586 | multicellular organismal-level iron ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.941; 覆盖度=83.27; E 值=2.64e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005774 | vacuolar membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.969; 覆盖度=99.62; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=29.13; 覆盖度=87.452; E 值=2.34e-28; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.753; 覆盖度=86.312; E 值=1.47e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030659 | cytoplasmic vesicle membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.753; 覆盖度=86.312; E 值=1.47e-26; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005381 | iron ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.753; 覆盖度=86.312; E 值=1.47e-26; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005384 | manganese ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.969; 覆盖度=99.62; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=33.969; 覆盖度=99.62; E 值=1.44e-38; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G01770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=26.941; 覆盖度=83.27; E 值=2.64e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pfa:PF3D7_1223700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=27.753; 覆盖度=86.312; E 值=1.47e-26 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |