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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_026767
当前查询版本OH1004
位置Chr06:2669797-2672871 (-)
描述Similar to PFC1: Ribosomal RNA small subunit methyltransferase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_026767 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g01860 质体 rRNA 小亚基中 3' 腺苷甲基化所需的。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0009409response to cold生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0031167rRNA methylation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005829cytosol细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.63; 覆盖度=80.531; E 值=4.09e-55; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafterUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000179rRNA (adenine-N6,N6-)-dimethyltransferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003723RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0016422mRNA (2'-O-methyladenosine-N6-)-methyltransferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151; UniProt GO evidence=ISS:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:005290816S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))-dimethyltransferase activity分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=36.63; 覆盖度=80.531; E 值=4.09e-55; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-ECUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGana:alr3229KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=32.601; 覆盖度=80.531; E 值=1.15e-40UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT1G01860KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=71.429; 覆盖度=84.661; E 值=2.07e-151UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGcmu:TC_0633KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.605; 覆盖度=82.891; E 值=1.79e-39UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGmta:Moth_0052KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=31.206; 覆盖度=83.186; E 值=1.32e-42UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release