基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025861 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:117805744-117806283 (+) |
| 描述 | Similar to PEX4: Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_025861 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At4g33970 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g24480 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g13340 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g19020 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g25550 |
通过调节细胞壁的形成与组装和/或生长极性来调节细胞形态发生。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009860 | pollen tube growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.903; 覆盖度=86.592; E 值=4.46e-46; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071555 | cell wall organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.903; 覆盖度=86.592; E 值=4.46e-46; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.08; 覆盖度=91.061; E 值=5.07e-45; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0090404 | pollen tube tip | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.903; 覆盖度=86.592; E 值=4.46e-46; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0099503 | secretory vesicle | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.08; 覆盖度=91.061; E 值=5.07e-45; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005199 | structural constituent of cell wall | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042277 | peptide binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.08; 覆盖度=91.061; E 值=5.07e-45; UniProt GO evidence=IPI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G24480 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.633; 覆盖度=88.268; E 值=1.83e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G13340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.08; 覆盖度=91.061; E 值=5.07e-45 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G33970 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=52.903; 覆盖度=86.592; E 值=4.46e-46 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G25550 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.203; 覆盖度=88.268; E 值=2.12e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |