基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_025566 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:113672787-113673483 (-) |
| 描述 | Similar to At5g66560: BTB/POZ domain-containing protein At5g66560 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_025566 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g66560 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g30440 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g03250 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g50840 |
可能作为 E3 泛素-蛋白连接酶复合物 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配子，介导靶蛋白的泛素化及随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g64330 |
可能作为 E3 泛素蛋白连接酶复合体 (CUL3-RBX1-BTB) 的底物特异性适配器，介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解 (通过相似性推测)。 |
Arabidopsis NPH3: A NPH1 photoreceptor-interacting protein essential for phototropism.1999 · DOI: 10.1126/science.286.5441.961 RPT2. A signal transducer of the phototropic response in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.2.225 RPT2 is a signal transducer involved in phototropic response and stomatal opening by association with phototropin 1 in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1105/tpc.019901
|
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.566; 覆盖度=94.857; E 值=8.51e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.566; 覆盖度=94.857; E 值=8.51e-31; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.146; 覆盖度=78.286; E 值=1.1e-24; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.566; 覆盖度=94.857; E 值=8.51e-31; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G30440 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=40.146; 覆盖度=78.286; E 值=1.1e-24 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G50840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.363; 覆盖度=64.571; E 值=2.09e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G03250 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=39.13; 覆盖度=65.714; E 值=1.05e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G66560 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=41.566; 覆盖度=94.857; E 值=8.51e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |