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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258 文献示例 LXL04_039733 TkAUNG001940

查询结果

下载当前结果

基因 IDLXL04_024025
当前查询版本OH1004
位置Chr05:78138554-78142665 (-)
描述Similar to CFM2: CRM-domain containing factor CFM2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024025 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01370 结合叶绿体中的特定 II 组内含子并促进其剪接。
A CRM domain protein functions dually in group I and group II intron splicing in land plant chloroplasts.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.055160
At3g23070 结合叶绿体中的特定 II 组内含子并促进其剪接。 暂无已核实直接文献
At4g14510 结合叶绿体中的特定 II 族内含子并促进其剪接。
The bRPS6-Family Protein RFC3 Prevents Interference by the Splicing Factor CFM3b during Plastid rRNA Biogenesis in Arabidopsis thaliana .2020 · DOI: 10.3390/plants9030328

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os11g0592400 结合叶绿体中的特定 II 组内含子并促进其剪接。
Two CRM protein subfamilies cooperate in the splicing of group IIB introns in chloroplasts.2008 · DOI: 10.1261/rna.1223708

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0000372Group I intron splicing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0000373Group II intron splicing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0048316seed development生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.323; 覆盖度=78.481; E 值=4.28e-144; UniProt GO evidence=IGI:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.167; 覆盖度=63.291; E 值=1.44e-156; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009532plastid stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKBUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:1990904ribonucleoprotein complex细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G01370KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=53.988; 覆盖度=108.439; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G23070KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.323; 覆盖度=78.481; E 值=4.28e-144UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGdosa:Os11g0592400KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=46.218; 覆盖度=62.764; E 值=2e-149UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGzma:100126360KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.167; 覆盖度=63.291; E 值=1.44e-156UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release