基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_022915 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr05:13534660-13536466 (-) |
| 描述 | Similar to GA20OX3: Gibberellin 20 oxidase 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_022915 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g07200 |
可能催化赤霉素生物合成中的氧化反应。 | |
At4g25420 |
赤霉素生物合成中的关键氧化酶,通过 GA 骨架 C-20 处的三步氧化,催化 GA12 转化为 GA9。 | |
At5g51810 |
赤霉素生物合成中的关键氧化酶,通过 GA 骨架 C-20 处的三步氧化,催化 GA12 转化为 GA9,并且还形成 GA25 作为次要产物。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0883800 |
可能催化赤霉素合成中的氧化反应。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009413 | response to flooding | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.405; 覆盖度=90.08; E 值=3.49e-115; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009416 | response to light stimulus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009639 | response to red or far red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.26; 覆盖度=96.783; E 值=8.22e-118; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009686 | gibberellin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125; UniProt GO evidence=IDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009739 | response to gibberellin | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=91.153; E 值=1.47e-122; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=91.153; E 值=1.47e-122; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048366 | leaf development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=91.153; E 值=1.47e-122; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048575 | short-day photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=91.153; E 值=1.47e-122; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045544 | gibberellin 20-oxidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051213 | dioxygenase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.405; 覆盖度=90.08; E 值=3.49e-115; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G25420 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.0; 覆盖度=91.153; E 值=1.47e-122 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G07200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.956; 覆盖度=98.391; E 值=6.92e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G51810 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=46.26; 覆盖度=96.783; E 值=8.22e-118 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0883800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.405; 覆盖度=90.08; E 值=3.49e-115 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |