基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_020997 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:118270425-118272488 (-) |
| 描述 | Similar to ZIP10: Probable zinc transporter 10 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_020997 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 20 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g31260 |
可能介导从根际吸收锌。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g19690 |
高亲和力铁转运蛋白,在根际铁通过根表皮层质膜的吸收中发挥关键作用。 | |
At5g45105 |
可能介导从根际吸收锌。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0667500 |
铁转运蛋白参与从根际穿过根表皮层质膜吸收铁。 | |
Os03g0667300 |
铁转运蛋白,可能在根际表皮层质膜从根际吸收铁中发挥作用。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006826 | iron ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006828 | manganese ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006829 | zinc ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006879 | intracellular iron ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015675 | nickel cation transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015691 | cadmium ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0030001 | metal ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071577 | zinc ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.124; 覆盖度=100.283; E 值=3.41e-149; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005768 | endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005769 | early endosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005773 | vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005802 | trans-Golgi network | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.124; 覆盖度=100.283; E 值=3.41e-149; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.124; 覆盖度=100.283; E 值=3.41e-149; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005375 | copper ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005381 | iron ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005384 | manganese ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005385 | zinc ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.124; 覆盖度=100.283; E 值=3.41e-149; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015086 | cadmium ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138; UniProt GO evidence=TAS:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G31260 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=64.124; 覆盖度=100.283; E 值=3.41e-149 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G19690 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=59.27; 覆盖度=100.85; E 值=2.56e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0667300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.213; 覆盖度=95.751; E 值=1.91e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0667500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.678; 覆盖度=96.884; E 值=5.42e-130 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |