基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_020809 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:109702183-109704976 (-) |
| 描述 | Similar to EIF4B1: Eukaryotic translation initiation factor 4B1 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_020809 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g26400 |
促进 eIF4F 和 eIF4A RNA 依赖的 ATP 水解活性,其效率随 mRNA 不同而变化,从而在翻译起始过程中实现 mRNA 的选择。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g13020 |
促进 eIF4F 和 eIF4A RNA 依赖的 ATP 水解活性,其效率随 mRNA 不同而变化,从而在翻译起始过程中实现 mRNA 的选择。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g38710 |
促进 eIF4F 和 eIF4A RNA 依赖的 ATP 水解活性,其效率随 mRNA 不同而变化,从而在翻译起始过程中实现 mRNA 的选择。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.607; 覆盖度=110.115; E 值=4.63e-109; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.607; 覆盖度=110.115; E 值=4.63e-109; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.522; 覆盖度=72.328; E 值=1.73e-25; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003743 | translation initiation factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042803 | protein homodimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119; UniProt GO evidence=ISS:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G13020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=50.607; 覆盖度=110.115; E 值=4.63e-109 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G26400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=50.346; 覆盖度=110.305; E 值=3.74e-119 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G38710 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=38.522; 覆盖度=72.328; E 值=1.73e-25 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |