基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019605 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:34986335-34991605 (-) |
| 描述 | Similar to POPTRDRAFT_821063: Alanine--tRNA ligase%2C chloroplastic/mitochondrial (Populus trichocarpa OX%3D3694) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019605 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g22800 |
催化丙氨酸连接到 tRNA(Ala) 的两步反应:首先丙氨酸被 ATP 激活形成 Ala-AMP,然后转移到 tRNA(Ala) 的受体端。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8B4H5 |
催化丙氨酸连接到 tRNA(Ala) 的两步反应:首先丙氨酸被 ATP 激活形成 Ala-AMP,然后转移到 tRNA(Ala) 的受体端。 | 暂无已核实直接文献 |
Os06g0245800 |
催化丙氨酸连接到 tRNA(Ala) 的两步反应:首先丙氨酸被 ATP 激活形成 Ala-AMP,然后转移到 tRNA(Ala) 的受体端。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006419 | alanyl-tRNA aminoacylation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.458; 覆盖度=91.81; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.458; 覆盖度=91.81; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000049 | tRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0002161 | aminoacyl-tRNA deacylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004813 | alanine-tRNA ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT5G22800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.458; 覆盖度=91.81; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os06g0245800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=72.889; 覆盖度=91.001; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:9266147 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=72.889; 覆盖度=91.001; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | pop:7472090 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.061; 覆盖度=92.922; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |