基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019478 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:32286297-32288952 (+) |
| 描述 | Similar to At1g54780: UPF0603 protein At1g54780%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_019478 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g54780 |
UPF0603 蛋白 At1g54780，叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os05g0401100 |
UPF0603蛋白Os05g0401100，叶绿体。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2Y4G9 |
UPF0603 蛋白 OsI_019212，叶绿体定位。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0010206 | photosystem II repair | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009534 | chloroplast thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009543 | chloroplast thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009579 | thylakoid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031977 | thylakoid lumen | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003993 | acid phosphatase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G54780 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=68.792; 覆盖度=101.361; E 值=2.77e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os05g0401100 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=77.253; 覆盖度=79.252; E 值=3.08e-124 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |