基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_019184 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:25549692-25553845 (+) |
| 描述 | Similar to TBL34: Protein trichome birefringence-like 34 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_019184 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 6 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g38320 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g01620 |
可能作为桥联蛋白,结合果胶及其他细胞壁多糖。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0817500 |
木聚糖乙酰转移酶,参与木聚糖中木糖残基2-O和3-O的单乙酰化。 | |
Os11g0107000 |
木聚糖乙酰转移酶,参与木聚糖中木糖残基2-O和3-O的单乙酰化。 | |
Os12g0106300 |
木聚糖乙酰转移酶,参与木聚糖中木糖残基2-O和3-O的单乙酰化。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.724; 覆盖度=86.396; E 值=8.24e-126; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045492 | xylan biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.591; 覆盖度=84.01; E 值=2.42e-121; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016413 | O-acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990538 | xylan O-acetyltransferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G38320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.242; 覆盖度=94.511; E 值=1.1e-138 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01620 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=46.591; 覆盖度=84.01; E 值=2.42e-121 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0817500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=46.381; 覆盖度=89.021; E 值=8.43e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os11g0107000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.724; 覆盖度=86.396; E 值=8.24e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4349561 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.724; 覆盖度=86.396; E 值=8.24e-126 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4351267 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.311; 覆盖度=86.635; E 值=1.39e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |