基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018461 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:13313744-13314271 (-) |
| 描述 | Similar to COPT3: Copper transporter 3 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_018461 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g59040 |
参与铜的运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g26975 |
参与铜的运输。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g46900 |
涉及铜的运输。 | |
At5g59030 |
铜转运蛋白,参与叶片中铜的获取和转运。 |
Identification of a copper transporter family in Arabidopsis thaliana.2003 · DOI: 10.1023/a:1022345507112
|
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os04g0415600 |
参与铜的运输。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006825 | copper ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=98.347; E 值=2.96e-10; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0035434 | copper ion transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.246; 覆盖度=100.826; E 值=5.33e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048235 | pollen sperm cell differentiation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=98.347; E 值=2.96e-10; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048364 | root development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=98.347; E 值=2.96e-10; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0098705 | copper ion import across plasma membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.204; 覆盖度=93.388; E 值=2.45e-10; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000325 | plant-type vacuole | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.624; 覆盖度=96.694; E 值=5.73e-13; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005886 | plasma membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.246; 覆盖度=100.826; E 值=5.33e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=98.347; E 值=2.96e-10; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005375 | copper ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.246; 覆盖度=100.826; E 值=5.33e-14; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0015089 | high-affinity copper ion transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.204; 覆盖度=93.388; E 值=2.45e-10; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G26975 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=31.624; 覆盖度=96.694; E 值=5.73e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G46900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=29.204; 覆盖度=93.388; E 值=2.45e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G59030 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.412; 覆盖度=98.347; E 值=2.96e-10 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G59040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=35.246; 覆盖度=100.826; E 值=5.33e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os04g0415600 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=30.833; 覆盖度=99.174; E 值=4.08e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |