基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018451 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:13142692-13146021 (+) |
| 描述 | Similar to truB: tRNA pseudouridine synthase B (Lactobacillus sakei subsp. sakei (strain 23K) OX%3D314315) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_018451 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0031119 | tRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.778; 覆盖度=27.439; E 值=3.1e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:1990481 | mRNA pseudouridine synthesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.778; 覆盖度=27.439; E 值=3.1e-16; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.778; 覆盖度=27.439; E 值=3.1e-16; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0160148 | tRNA pseudouridine(55) synthase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.778; 覆盖度=27.439; E 值=3.1e-16; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | fjo:Fjoh_0570 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.053; 覆盖度=28.963; E 值=5.78e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | lsa:LCA_1242 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.778; 覆盖度=27.439; E 值=3.1e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mjl:Mjls_2078 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=43.0; 覆盖度=30.488; E 值=9.79e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mkm:Mkms_2141 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=43.0; 覆盖度=30.488; E 值=9.79e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmc:Mmcs_2095 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.0; 覆盖度=30.488; E 值=9.79e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |