基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_018437 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr04:12938594-12939556 (+) |
| 描述 | Similar to RPS2D: 40S ribosomal protein S2-4 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_018437 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 7 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g57490 |
小核糖体亚基蛋白 uS5w。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q93VB8 |
小核糖体亚基蛋白 uS5y/uS5u/uS5v。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g58380 |
小核糖体亚基蛋白 uS5z。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g41840 |
核糖体的组分，核糖核蛋白复合体的一部分，负责细胞内蛋白质的合成。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=83.122; 覆盖度=86.496; E 值=7.38e-143; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=3.51e-144; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=83.122; 覆盖度=86.496; E 值=7.38e-143; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=3.51e-144; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022626 | cytosolic ribosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=83.122; 覆盖度=86.496; E 值=7.38e-143; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022627 | cytosolic small ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.253; 覆盖度=85.036; E 值=6.11e-129; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146; UniProt GO evidence=IDA:CAFA | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G58380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=5.14e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G58684 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=3.51e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G58983 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=3.51e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT1G59359 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=84.388; 覆盖度=86.496; E 值=3.51e-144 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G41840 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=83.122; 覆盖度=86.496; E 值=7.38e-143 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G57490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=88.688; 覆盖度=80.657; E 值=7.5e-146 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ipu:100304556 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=77.253; 覆盖度=85.036; E 值=6.11e-129 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |