基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_016490 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:124770764-124773800 (+) |
| 描述 | Similar to NUG2: Nuclear/nucleolar GTPase 2 (Oryza sativa subsp. indica OX%3D39946) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_016490 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 9 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g52980 |
GTPase 参与 60S 前核糖体亚基的成熟。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os03g0352400 |
GTPase 参与 60S 前核糖体亚基的成熟。 | |
UniProt: A2XGQ1 |
参与前 60S 核糖体亚基成熟的 GTP 酶。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0042254 | ribosome biogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.55; 覆盖度=99.231; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.55; 覆盖度=99.231; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005730 | nucleolus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.905; 覆盖度=101.154; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.606; 覆盖度=95.769; E 值=1.56e-175; UniProt GO evidence=HDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003723 | RNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.606; 覆盖度=95.769; E 值=1.56e-175; UniProt GO evidence=HDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003729 | mRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.55; 覆盖度=99.231; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003924 | GTPase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.55; 覆盖度=99.231; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005525 | GTP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.905; 覆盖度=101.154; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016787 | hydrolase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.905; 覆盖度=101.154; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G52980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=76.55; 覆盖度=99.231; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os03g0352400 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.905; 覆盖度=101.154; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | hsa:29889 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=51.606; 覆盖度=95.769; E 值=1.56e-175 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:230737 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.385; 覆盖度=100.0; E 值=6.94e-176 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |