基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012903 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:20673511-20673885 (-) |
| 描述 | Protein of unknown function |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012903 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g29640 |
蛋白 S40-1。 | 暂无已核实直接文献 |
At5g45630 |
蛋白质S40-2。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g18980 |
通过调节 WRKY53 或激活 SAG12 来调控衰老。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002215 | defense response to nematode | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.095; 覆盖度=101.613; E 值=5.24e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009617 | response to bacterium | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009646 | response to absence of light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.5; 覆盖度=103.226; E 值=2.43e-12; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009751 | response to salicylic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.5; 覆盖度=103.226; E 值=2.43e-12; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010150 | leaf senescence | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010468 | regulation of gene expression | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.095; 覆盖度=101.613; E 值=5.24e-11; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0071456 | cellular response to hypoxia | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.5; 覆盖度=103.226; E 值=2.43e-12; UniProt GO evidence=HEP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G29640 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=36.242; 覆盖度=120.161; E 值=6.11e-16 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G18980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=38.095; 覆盖度=101.613; E 值=5.24e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G45630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=37.5; 覆盖度=103.226; E 值=2.43e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |