基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012901 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:20664789-20666103 (+) |
| 描述 | Similar to At3g03040: F-box protein At3g03040 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_012901 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g03040 |
F-盒蛋白 At3g03040。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g27050 |
SCF(ASK-cullin-F-box) E3 泛素连接酶复合物的组成部分,可能介导靶蛋白的泛素化和随后的蛋白酶体降解。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g42770 |
推定的 F-盒/LRR 重复蛋白 At3g42770。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g03220 |
推定的F-box/FBD/LRR重复蛋白At4g03220。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g59170 |
推定的F-box/LRR重复蛋白 At3g59170。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000209 | protein polyubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.923; 覆盖度=76.098; E 值=4.82e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006952 | defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.879; 覆盖度=84.39; E 值=7.85e-15; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016036 | cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.923; 覆盖度=76.098; E 值=4.82e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.395; 覆盖度=79.024; E 值=1.06e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.879; 覆盖度=84.39; E 值=7.85e-15; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.395; 覆盖度=79.024; E 值=1.06e-14; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.923; 覆盖度=76.098; E 值=4.82e-13; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061630 | ubiquitin protein ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.923; 覆盖度=76.098; E 值=4.82e-13; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G03040 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=26.879; 覆盖度=84.39; E 值=7.85e-15 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G42770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.923; 覆盖度=76.098; E 值=4.82e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G59170 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=25.128; 覆盖度=95.122; E 值=1.51e-12 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G03220 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=29.219; 覆盖度=96.829; E 值=6.12e-13 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G27050 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=28.395; 覆盖度=79.024; E 值=1.06e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |