基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_012614 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr03:15631960-15633948 (-) |
| 描述 | Similar to DAPF: Diaminopimelate epimerase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_012614 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g53580 |
通过“二基”机制作用的消旋酶，其中一个活性位点的半胱氨酸作为碱抽取氨基酸的α-质子，而第二个半胱氨酸硫醇作为酸将所得平面羧负离子中间体从相对面重新质子化。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os12g0567200 |
二氨基苏氨酸表异构酶，叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: A2ZLS4 |
推定的二氨基庚二酸表异构酶，叶绿体型。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009089 | L-lysine biosynthetic process via diaminopimelate | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008837 | diaminopimelate epimerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ana:alr2048 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.915; 覆盖度=76.757; E 值=4.45e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G53580 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.577; 覆盖度=100.27; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os12g0567200 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=73.651; 覆盖度=85.135; E 值=1.15e-171 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:slr1665 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=64.561; 覆盖度=77.027; E 值=6.71e-134 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |