基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_011312 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:162390144-162392793 (+) |
| 描述 | Similar to TATC: Sec-independent protein translocase protein TATC%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011312 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g01110 |
双精氨酸易位 系统的一部分,该系统将信号肽中包含特征性双精氨酸基序的大折叠蛋白跨类囊体膜转运。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0501700 |
双精氨酸转运(Tat)系统的一部分,该系统将包含特征性双精氨酸基序的折叠大蛋白通过类囊体膜转运。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009567 | double fertilization forming a zygote and endosperm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010027 | thylakoid membrane organization | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043953 | protein transport by the Tat complex | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045038 | protein import into chloroplast thylakoid membrane | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=68.563; 覆盖度=57.094; E 值=6.37e-135; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0065002 | intracellular protein transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009535 | chloroplast thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0033281 | TAT protein transport complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042651 | thylakoid membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043235 | receptor complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009977 | proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G01110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=66.374; 覆盖度=58.462; E 值=6.29e-141 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0501700 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=84.127; 覆盖度=43.077; E 值=3.6e-128 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | syn:sll0194 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=60.169; 覆盖度=40.342; E 值=4.07e-97 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |