基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_011176 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:159385284-159390344 (+) |
| 描述 | Similar to TADA: tRNA(adenine(34)) deaminase%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_011176 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 8 条 GO 注释和 4 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g68720 |
在 tRNA-Arg(ACG) 中将腺苷脱氨为次黄嘌呤。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0002100 | tRNA wobble adenosine to inosine editing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010311 | lateral root formation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008251 | tRNA-specific adenosine deaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008270 | zinc ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.195; 覆盖度=14.825; E 值=5.1e-33; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0052717 | tRNA-specific adenosine-34 deaminase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-EC | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G68720 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.267; 覆盖度=32.895; E 值=3.73e-89 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | bsu:BSU00180 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=43.195; 覆盖度=14.825; E 值=5.1e-33 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sav:SAV0558 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=40.884; 覆盖度=15.877; E 值=1.82e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | stm:STM2568 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=39.583; 覆盖度=16.842; E 值=1.87e-30 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |