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基因注释

展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。

查询结果

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基因 IDLXL04_011017
当前查询版本OH1004
位置Chr02:156533728-156535557 (-)
描述Similar to At5g13770: Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g13770%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702)
注释来源组装GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

功能注释来源:OH1004 · LXL04_011017 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g13770 含有五肽重复的蛋白质 At5g13770,叶绿体的。 暂无已核实直接文献
At5g42310 需要用于叶绿体蛋白合成以及类囊体蛋白复合体亚基的积累。
At5g04810 可能在质体核糖体生物发生中起作用。 暂无已核实直接文献
At3g22470 含五重复肽的蛋白At3g22470,线粒体。 暂无已核实直接文献
At3g16010 含五重复肽的蛋白 At3g16010。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

GO / KEGG

以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。

类型ID名称命名空间证据来源
GOGO:0006396RNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.002; 覆盖度=90.476; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006397mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0006417regulation of translation生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KWUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009658chloroplast organization生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.002; 覆盖度=90.476; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0010239chloroplast mRNA processing生物过程Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IMP:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005737cytoplasm细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IBA:GO_CentralUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0005739mitochondrion细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=24.181; 覆盖度=65.189; E 值=2.58e-30; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009507chloroplast细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.002; 覆盖度=90.476; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009534chloroplast thylakoid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCellUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0009570chloroplast stroma细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042644chloroplast nucleoid细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0042651thylakoid membrane细胞组分Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003727single-stranded RNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
GOGO:0003729mRNA binding分子功能Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.002; 覆盖度=90.476; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIRUniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT3G22470KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=24.181; 覆盖度=65.189; E 值=2.58e-30UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G13770KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=49.002; 覆盖度=90.476; E 值=0.0UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release
KEGGath:AT5G42310KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pendingSwiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=24.416; 覆盖度=63.218; E 值=1.01e-31UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release