基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_010907 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:155061881-155063136 (+) |
| 描述 | Similar to NRPE5C: DNA-directed RNA polymerase V subunit 5C (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010907 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g54490 |
DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g57080 |
DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 | |
At2g41340 |
DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g22320 |
DNA 依赖性 RNA 聚合酶使用四种核糖核苷三磷酸作为底物催化 DNA 转录为 RNA。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006362 | transcription elongation by RNA polymerase I | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006366 | transcription by RNA polymerase II | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042797 | tRNA transcription by RNA polymerase III | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000418 | RNA polymerase IV complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.593; 覆盖度=93.506; E 值=8.47e-56; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000419 | RNA polymerase V complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005665 | RNA polymerase II, core complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005666 | RNA polymerase III complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005736 | RNA polymerase I complex | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003899 | DNA-directed RNA polymerase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G41340 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=42.593; 覆盖度=93.506; E 值=8.47e-56 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G22320 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=36.634; 覆盖度=87.446; E 值=8.96e-38 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G54490 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.703; 覆盖度=96.104; E 值=2.06e-73 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G57080 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=45.283; 覆盖度=91.775; E 值=6.06e-57 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | cbr:CBG_12745 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=33.171; 覆盖度=88.745; E 值=1.98e-31 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |