基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_008131 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:88603226-88604940 (+) |
| 描述 | Similar to COR27: Cold-regulated protein 27 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_008131 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 14 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g42900 |
与COR28共同参与中心生物钟的调控及开花促进,通过结合昼夜节律相关晚期基因TOC1、PRR5、ELF4及冷响应基因的染色质以抑制其转录。 | |
At4g33980 |
与 COR27 一起,通过结合到与钟相关的晚间基因 TOC1、PRR5、ELF4 的染色质及响应寒冷的基因,从而参与中央生物钟调控并促进开花,抑制它们的转录。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009409 | response to cold | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009615 | response to virus | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009637 | response to blue light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009646 | response to absence of light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009737 | response to abscisic acid | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010114 | response to red light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010228 | vegetative to reproductive phase transition of meristem | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042752 | regulation of circadian rhythm | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045892 | negative regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048511 | rhythmic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048573 | photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.146; 覆盖度=43.85; E 值=2.3e-07; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000028 | regulation of photoperiodism, flowering | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IMP:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G33980 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=34.146; 覆盖度=43.85; E 值=2.3e-07 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G42900 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=31.22; 覆盖度=109.626; E 值=1.3e-14 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |