基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_006531 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr02:13025329-13030021 (+) |
| 描述 | Similar to SCPL25: Serine carboxypeptidase-like 25 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_006531 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 5 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At3g02110 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g30610 |
活性丝氨酸羧肽酶,具有广泛的底物偏好,包括碱性基团和亲水基团。 | |
At2g24010 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At2g24000 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g07990 |
可能的羧肽酶。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006508 | proteolysis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.749; 覆盖度=86.863; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009742 | brassinosteroid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.211; 覆盖度=87.451; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005576 | extracellular region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.749; 覆盖度=86.863; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005615 | extracellular space | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.211; 覆盖度=87.451; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004185 | serine-type carboxypeptidase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.749; 覆盖度=86.863; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G24000 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=60.497; 覆盖度=86.863; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G24010 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=61.174; 覆盖度=86.863; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G02110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=76.749; 覆盖度=86.863; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G07990 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=56.757; 覆盖度=87.059; E 值=4.05e-178 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G30610 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=61.211; 覆盖度=87.451; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |