基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002823 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:58947382-58948987 (+) |
| 描述 | Similar to rplO: 50S ribosomal protein L15 (Methylobacterium radiotolerans (strain ATCC 27329 / DSM 1819 / JCM 2831 / NBRC 15690 / NCIMB 10815 / 0-1) OX%3D426355) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002823 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 4 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.258; 覆盖度=55.957; E 值=2.46e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0022625 | cytosolic large ribosomal subunit | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.258; 覆盖度=55.957; E 值=2.46e-42; UniProt GO evidence=IEA:TreeGrafter | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003735 | structural constituent of ribosome | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.258; 覆盖度=55.957; E 值=2.46e-42; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019843 | rRNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.258; 覆盖度=55.957; E 值=2.46e-42; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniRule | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | mch:Mchl_2460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=48.765; 覆盖度=58.484; E 值=2.33e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | met:M446_0334 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=49.669; 覆盖度=54.513; E 值=7.41e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mex:Mext_2182 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=48.765; 覆盖度=58.484; E 值=2.33e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mno:Mnod_1927 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.331; 覆盖度=54.513; E 值=4.97e-41 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mrd:Mrad2831_2199 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=52.258; 覆盖度=55.957; E 值=2.46e-42 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |