基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_002019 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:39714752-39715866 (+) |
| 描述 | Similar to PDF1A: Peptide deformylase 1A%2C chloroplastic (Solanum lycopersicum OX%3D4081) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_002019 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At1g15390 |
去除新合成蛋白质 N 端 Met 的甲酰基。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
Os01g0555800 |
去除新合成蛋白质 N 端 Met 的甲酰基。 | 暂无已核实直接文献 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006412 | translation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008284 | positive regulation of cell population proliferation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.449; 覆盖度=62.456; E 值=2.51e-39; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0018206 | peptidyl-methionine modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.449; 覆盖度=62.456; E 值=2.51e-39; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0043687 | post-translational protein modification | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.449; 覆盖度=62.456; E 值=2.51e-39; UniProt GO evidence=ISO:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051604 | protein maturation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.329; 覆盖度=72.632; E 值=2.3e-110; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009505 | plant-type cell wall | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.329; 覆盖度=72.632; E 值=2.3e-110; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.329; 覆盖度=72.632; E 值=2.3e-110; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009570 | chloroplast stroma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0042586 | peptide deformylase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046872 | metal ion binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G15390 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.329; 覆盖度=72.632; E 值=2.3e-110 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os01g0555800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=70.769; 覆盖度=68.421; E 值=2.27e-96 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | gvi:glr1729 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=50.857; 覆盖度=61.404; E 值=9.82e-49 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:68023 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=40.449; 覆盖度=62.456; E 值=2.51e-39 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | sly:544225 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=63.158; 覆盖度=100.0; E 值=1.74e-116 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |