基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_001701 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:31534135-31538292 (-) |
| 描述 | Similar to UBA2: Ubiquitin-activating enzyme E1 2 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_001701 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 12 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g06460 |
首先用 ATP 对其 C 末端甘氨酸残基进行腺苷酸化,然后将该残基连接到 E1 中半胱氨酸残基的侧链,从而产生泛素-E1 硫酯和游离 AMP,从而激活泛素。 | |
At2g30110 |
首先用 ATP 对其 C 末端甘氨酸残基进行腺苷酸化,然后将该残基连接到 E1 中半胱氨酸残基的侧链,从而产生泛素-E1 硫酯和游离 AMP,从而激活泛素。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006511 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006974 | DNA damage response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051707 | response to other organism | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.181; 覆盖度=91.449; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005737 | cytoplasm | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005777 | peroxisome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.181; 覆盖度=91.449; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005829 | cytosol | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.181; 覆盖度=91.449; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009506 | plasmodesma | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.181; 覆盖度=91.449; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004839 | ubiquitin activating enzyme activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TIGR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0004842 | ubiquitin-protein transferase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G30110 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=76.181; 覆盖度=91.449; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G06460 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=74.709; 覆盖度=92.889; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |