基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000946 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:17060427-17062875 (-) |
| 描述 | Similar to RUS2: Protein root UVB sensitive 2%2C chloroplastic (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000946 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 6 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g31190 |
参与根 UV-B 传感通路并防止对极低注量率 UV-B 过敏。 | |
At5g49820 |
对正常胚胎发育必需。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g13770 |
蛋白 根部 UVB 敏感 3。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0009926 | auxin polar transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.276; 覆盖度=102.358; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010224 | response to UV-B | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.276; 覆盖度=102.358; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009507 | chloroplast | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.07; 覆盖度=80.896; E 值=1.03e-43; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.276; 覆盖度=102.358; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009941 | chloroplast envelope | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.276; 覆盖度=102.358; E 值=0.0; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016020 | membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.79; 覆盖度=88.915; E 值=3.44e-34; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G13770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=26.558; 覆盖度=87.028; E 值=5.27e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G31190 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=70.276; 覆盖度=102.358; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G49820 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=32.07; 覆盖度=80.896; E 值=1.03e-43 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | mmu:233913 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.822; 覆盖度=89.858; E 值=4.03e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | rno:361654 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=26.79; 覆盖度=88.915; E 值=3.44e-34 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |