基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000523 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:9798854-9800796 (-) |
| 描述 | Similar to MBD7: Methyl-CpG-binding domain-containing protein 7 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000523 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 11 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g59800 |
转录调控因子,可结合启动子中的CpG岛,其中DNA在CpG二核苷酸内的胞嘧啶第5位发生甲基化。 |
Characterization of Arabidopsis thaliana methyl-CpG-binding domain (MBD) proteins.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01756.x The three methyl-CpG-binding domains of AtMBD7 control its subnuclear localization and mobility.2008 · DOI: 10.1074/jbc.m706221200
|
At5g59380 |
转录调控因子,可结合启动子中的 CpG、CpNpN 和 CpNpG (N 是 A、T 或 C) 岛,不受 DNA 甲基化状态影响。 |
Characterization of Arabidopsis thaliana methyl-CpG-binding domain (MBD) proteins.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01756.x Arabidopsis MBD proteins show different binding specificities and nuclear localization.2003 · DOI: 10.1023/b:plan.0000019118.56822.a9
|
At3g46580 |
转录调控因子,可结合启动子中的CpG岛,其中DNA在CpG二核苷酸内的胞嘧啶第5位发生甲基化。 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031047 | regulatory ncRNA-mediated gene silencing | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000792 | heterochromatin | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005694 | chromosome | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005731 | nucleolus organizer region | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009536 | plastid | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010369 | chromocenter | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010370 | perinucleolar chromocenter | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0008327 | methyl-CpG binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0019899 | enzyme binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21; UniProt GO evidence=IPI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT3G46580 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=27.326; 覆盖度=47.778; E 值=3.69e-09 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G59380 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=28.834; 覆盖度=45.278; E 值=5.13e-11 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G59800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=28.086; 覆盖度=90.0; E 值=2.26e-21 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |