基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000398 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:7398808-7400741 (-) |
| 描述 | Similar to BHLH48: Transcription factor bHLH48 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_000398 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 5 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g42300 |
转录因子bHLH48。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g57800 |
转录因子 bHLH60。 | 暂无已核实直接文献 |
At4g34530 |
转录因子,可结合 DNA 中的 G 盒 5'-CACGTG-3',在体外也能在较低程度上结合 E 盒 5'-CANNTG-3'。 |
水稻
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
UniProt: B8AH97 |
与BCL1共同作用,通过增加赤霉素(GA)生物合成,至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。 | 暂无已核实直接文献 |
Os02g0705500 |
与BCL1共同作用,通过增加赤霉素(GA)生物合成,至少部分地作为细胞伸长的正调节因子。 |
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006351 | DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=TAS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009637 | response to blue light | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.75; 覆盖度=28.571; E 值=6.75e-40; UniProt GO evidence=IDA:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009740 | gibberellic acid mediated signaling pathway | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.359; 覆盖度=46.429; E 值=1.61e-40; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009908 | flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.75; 覆盖度=28.571; E 值=6.75e-40; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009911 | positive regulation of flower development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.75; 覆盖度=28.571; E 值=6.75e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0010372 | positive regulation of gibberellin biosynthetic process | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.359; 覆盖度=46.429; E 值=1.61e-40; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0045824 | negative regulation of innate immune response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.75; 覆盖度=28.571; E 值=6.75e-40; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051510 | regulation of unidimensional cell growth | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=3; 一致性=49.359; 覆盖度=46.429; E 值=1.61e-40; UniProt GO evidence=IEA:EnsemblPlants | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003677 | DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003700 | DNA-binding transcription factor activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=ISS:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0046983 | protein dimerization activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66; UniProt GO evidence=IEA:InterPro | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT2G42300 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=48.11; 覆盖度=86.607; E 值=3.44e-66 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT3G57800 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=41.067; 覆盖度=111.607; E 值=5.04e-59 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT4G34530 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=5; 一致性=68.75; 覆盖度=28.571; E 值=6.75e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | dosa:Os02g0705500 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.359; 覆盖度=46.429; E 值=1.68e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | osa:4330462 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=49.359; 覆盖度=46.429; E 值=1.68e-40 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |