基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | LXL04_000004 |
|---|---|
| 当前查询版本 | OH1004 |
| 位置 | Chr01:91872-97366 (-) |
| 描述 | Similar to BRCA2B: Protein BREAST CANCER SUSCEPTIBILITY 2 homolog B (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源：OH1004 · LXL04_000004 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 10 条 GO 注释和 2 条 KEGG 基因交叉引用；只下载当前查询结果，不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因；橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At5g01630 |
通过介导RAD51和DMC1促进的DNA修复，参与双链断裂修复和/或同源重组。 | 暂无已核实直接文献 |
UniProt: Q7Y1C5 |
通过介导RAD51和DMC1促进的DNA修复，参与双链断裂修复和/或同源重组。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目，保留原始同源转移证据及覆盖度；其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0000724 | double-strand break repair via homologous recombination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=IGI:UniProtKB | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0006355 | regulation of DNA-templated transcription | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009553 | embryo sac development | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.274; 覆盖度=37.261; E 值=3.42e-165; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0009793 | embryo development ending in seed dormancy | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.274; 覆盖度=37.261; E 值=3.42e-165; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0031347 | regulation of defense response | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.274; 覆盖度=37.261; E 值=3.42e-165; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0048314 | embryo sac morphogenesis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.274; 覆盖度=37.261; E 值=3.42e-165; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0051321 | meiotic cell cycle | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005739 | mitochondrion | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=HDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0003697 | single-stranded DNA binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT4G00020 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=54.274; 覆盖度=37.261; E 值=3.42e-165 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT5G01630 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=55.172; 覆盖度=36.943; E 值=2.87e-169 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |